Zakład Mikrobiologii Farmaceutycznej prowadzi interdyscyplinarne badania łączące diagnostykę mikrobiologiczną oraz mikrobiologię farmaceutyczną. 

Prowadzone projekty naukowe obejmują: 

• Badania nad nowymi substancjami o działaniu antybakteryjnym
  Jednostka prowadzi intensywne badania nad nowymi związkami o aktywności antybakteryjnej oraz antybiofilmowej, ukierunkowane na bakterie stanowiące istotne wyzwania terapeutyczne w tym Enterococcus spp., Staphylococcus aureus, Staphylococcus epidermidis, Acinetobacter baumannii i Helicobacter pylori.  

• Badania adjuwantów wzmacniających działanie antybiotyków
  Zakład  prowadzi badania nad nowymi strategiami wspomagania terapii przeciwbakteryjnej, w tym nad związkami mającymi aktywność adjuwantów antybiotyków. Celem tych badań jest identyfikacja substancji, które mogą zwiększać skuteczność leków przeciwbakteryjnych poprzez zahamowanie mechanizmów oporności bakterii, w tym poprzez blokowanie pomp wyrzutu leków oraz modulację miejsc docelowych działania antybiotyków. Badania te prowadzone są wobec bakterii takich jak Enterococcus spp., Staphylococcus aureus, Staphylococcus epidermidis, Escherichia coli i Klebsiella aerogenes. Dotychczasowo znalezione adjuwanty antybiotyków należą m.in. do pochodnych hydantoiny i imidazolonu.

• Analiza mechanizmów oporności na antybiotyki i czynników wirulencji patogenów klinicznych
  Prace badawcze obejmują analizę genetycznych determinant oporności oraz czynników wirulencji różnych patogenów, takich jak Helicobacter pylori, Enterococcus spp., czy Mycobacterium spp.. Stosowane metody obejmują techniki molekularne (PCR, RT-PCR, sekwencjonowanie) oraz fenotypowe.

• Epidemiologia zakażeń i analiza danych klinicznych
  Jednostka realizuje badania nad występowaniem i rozprzestrzenianiem się patogenów, zarówno w środowisku szpitalnym, jak i populacyjnym. Przykładem jest analiza danych epidemiologicznych dotyczących zakażeń Klebsiella pneumoniae czy Eschericha coli w środowisku szpitalnym jak również dotyczących epidemiologii zakażenia HIV w Polsce.

• Analiza właściwości antybakteryjnych biomateriałów i nanocząstek
  Badania obejmują ocenę biomateriałów o działaniu przeciwdrobnoustrojowym, które znajdują zastosowanie w medycynie regeneracyjnej, implantologii oraz leczeniu zakażeń. Prace skupiają się na biomateriałach ograniczających powstawanie biofilmu bakteryjnego oraz analizie synergistycznego działania nanocząstek srebra z antybiotykami.